11º Encontro Nacional de Tecnologia Química
Realizado em Tereseina/PI, de 11 a 13 de Setembro de 2019.
ISBN 978-85-85905-26-2

TÍTULO: ESTUDO POR ANCORAMENTO MOLECULAR DA INTERAÇÃO DO FLAVONOIDE (-) epi-catequina COM A ENZIMA 5-LOX.

AUTORES: Carvalho, G.F.S. (UESPI) ; Uchôa, V.T. (UESPI) ; Ramos, R.M. (IFPI) ; Costa Junior, F.L.C. (IFPI) ; Carneiro, R.S. (UESPI) ; Sousa, H.G. (UESPI)

RESUMO: No processo de inflamação pulmonar são metabolizados leucotrienos através da enzima 5-LOX. A (-)epi-catequina apresenta ação anti-inflamatória comprovada. A abordagem in silico tem gerado previsões confiáveis no modo de ação de drogas. O objetivo deste trabalho foi investigar a interação entre a (-)epi-catequina e enzima 5-LOX como possível alvo farmacológico no processo de inflamação pulmonar por ancoramento molecular. Foi realizada comparação para os complexos 5-Lox-AracA e 5-Lox-EpiC em parâmetros como ΔG, Ki, Ligações de Hidrogênio e interações hidrofóbicas utilizando os softwares Autodock e Auto Vina. O complexo 5-Lox-EpiC apresentou melhores resultados para ΔG e Ki. Sugerimos a inibição da enzima 5-LOX pela (-)epi-catequina, evidenciando sua ação anti-inflamatória.

PALAVRAS CHAVES: Ancoramento Molecular; 5- lipoxigenase; Inflamação Pulmonar

INTRODUÇÃO: A forma como moléculas e proteínas interagem tem papel crucial em processos fisiopatológicos, sendo importante para o planejamento de medicamentos (VERLI, 2014). A abordagem in silico tem demonstrado capacidade de gerar previsões confiáveis sobre o modo de ação das drogas ajudando a reduzir os custos do desenvolvimento de fármacos (PIÑERO et al., 2018). No ancoramento molecular, possíveis moléculas bioativas são testadas para um determinado alvo molecular a fim de estabelecer qual delas apresentam melhor acomodação ao sítio ativo do alvo. Os resultados obtidos são dados em termos da energia de ligação necessária para que a provável molécula bioativa se ligue ao sítio ativo do alvo molecular selecionado (BARROS, 2015). Existem diversos programas de ancoramento molecular disponíveis. Uns dos programas mais utilizados são o AutoDock e AutoDock Vina, cuja função de pontuação é estabelecida na hidrofobicidade, ligações de hidrogênio, interações estéricas e no número de ligações rotativas ativas (BARBOSA, 2016). No processo de inflamação aguda, as fosfolipases celulares são ativadas para decompor os fosfolipídios da membrana em ácido araquidônico, que por sua vez é metabolizado para prostaglandinas e leucotrienos pelas enzimas ciclooxigenase (COX) e lipoxigenase (LOX) (MEKA et al., 2018). Existem vários tipos de LOX (5-, 9-, 12- e 15-LOX), estando a iso-formas 5-LOX relacionada ao processo de inflamação pulmonar (CZAPSKI et al., 2016). Este trabalho pretende, através de estudos por ancoramento molecular, investigar a interação entre a (-)epi-catequina e enzima 5- LOX como possível alvo farmacológico no processo de inflamação pulmonar.

MATERIAL E MÉTODOS: Os testes computacionais foram realizados no Laboratório de Pesquisa em Sistemas de Informação (IFPI). Os cálculos de ancoramento molecular foram aplicados utilizando o software Autodock 4.2 (MORRIS et al., 2008) e Autodock Vina, versão 1.1.2 (TROTT e OLSON, 2010). Autodock Tools (ADT), versão 1.5.6, foi usado para preparar proteínas e ligantes para cálculos de ancoramento. O Autodock foi configurado de acordo com Ramos et al., 2012. O Autodock Vina e o Autodock usaram caixa de grids do mesmo tamanho. Os centros dos grids de afinidade foram definidos no resíduo de sítio ativo Phe177 do 5-Lox. A estrutura 3D da cadeia de Arachidonate 5-lipoxigenase (5- Lox) foi obtida a partir do Protein Data Bank (PDB ID: 3V92). As estruturas tridimensionais dos ligantes Ácido Araquidônico (AracA) e Epi-Catequina (EpiC) foram obtidas do Projeto PubChem (CID 444899 e 72276, respectivamente).

RESULTADOS E DISCUSSÃO: A Tab. 1 mostra os resultados do ancoramento molecular. Observa-se que o complexo 5-Lox-EpiC apresentou melhores resultados para energia de ligação e constante de inibição (-6,83 kcal / mol e 9,87 μM, respectivamente) quando comparado aos resultados para o complexo 5-Lox-AracA (-6,79 kcal / mol e 10,49 μM, respectivamente), tendo em conta os resultados obtidos com o software Autodock. O complexo 5-Lox-EpiC formou quatro ligações de hidrogênio (Ala424, Trp599, Leu420, Tyr181) enquanto o complexo 5-Lox-AracA formou duas ligações de hidrogênio (His600, Asn425). O complexo 5-Lox-AracA apresentou maior número de interações hidrofóbicas, o que pode ser explicado devido ao seu maior volume molecular. Em relação ao Autodock Vina, o complexo 5-Lox-EpiC também apresentou melhor resultado para energia de ligação (-5,5 kcal / mol) quando comparado ao complexo 5-Lox-AracA (-4,4 Kcal / mol). A fig. 1 mostra a conformação resultante do acoplamento. Observa-se que os ligantes estão na região do sítio ativo de 5-Lox próximo ao resíduo Phe177. Sabe-se que o efeito farmacológico dos flavonoides se deve ao caráter inibidor enzimático desses compostos (REDREJO et al., 2004). Os resultados dos estudos in silico com a 5-Lox indicam que o ligante EpiC apresentou parâmetros de afinidade melhores que o ligante AracA, comprovando uma maior probabilidade da enzima interagir com o flavonoide do que com seu ligante natural, inibindo a metabolização de ácido araquidônico em leucotrienos, atenuando o processo inflamatório pulmonar, sugerindo ação anti-inflamatória da (-) epi-catequina. Resultados semelhantes podem ser observados in vivo por Ruijters et al. (2014) e Xing et al. (2019) que presentaram a (-) epi-catequina como uma nova opção terapêutica no tratamento da lesão pulmonar aguda.

Tabela 1

Parâmetros de afinidade do ancoramento molecular

Figura 1

Estrutura global das conformações resultado de ancoramento molecular. 5-LOX é mostrado em uma superfície transparente.

CONCLUSÕES: Diante da avaliação in silico, através do estudo por ancoramento molecular, os resultados sugerem a inibição da enzima envolvida no processo de inflamação pulmonar, 5-LOX, pelo flavonoide (-) epi-catequina. Desta forma evitando a liberação de leucotrienos, comprovando a ação anti-inflamatória deste flavonoide presente em diferentes plantas utilizadas na medicina popular.

AGRADECIMENTOS:

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICA: BARBOSA, U. R. Seleção de compostos naturais candidatos à inibição da enzima isocitrato liase do Paracoccidioides spp.: uma abordagem por triagem virtual e dinâmica molecular. 2016. 61 f. Dissertação (Mestrado), Univ. Federal de Goiás, Jataí, 2016.

BARROS, Maria Ester de Sá Barreto. Estudos de Docking Molecular, síntese e atividade biológica de análogos da (-)-massoialactona e da combretastatina A-4. 2015. (tese de doutorado).
CZAPSKI, G. A. et al. The lipoxygenases: their regulation and implication in Alzheimer’s disease. Neurochemical research, v. 41, n. 1-2, p. 243-257, 2016.
MEKA, B. et al. Synthesis, in vitro and in silico evaluation of diaryl heptanones as potential 5LOX enzyme inhibitors. Bioorganic chemistry, v. 80, p. 408-421, 2018.
PIÑERO, J.; FURLONG, L. I.; SANZ, F. In silico models in drug development: where we are. Current opinion in pharmacology, v. 42, p. 111-121, 2018.

RAMOS, R. M.; PEREZ, J. M.; BAPTISTA, L. A.; DE AMORIM, H. L. N. Interaction of wild type, G68R and L125M isoforms of the arylamine-N-acetyltransferase from Mycobacterium tuberculosis with isoniazid: a computational study on a new possible mechanism of resistance. Journal of molecular modeling, v. 18, p. 4013-4024, 2012.

REDREJO-RODRIGUEZ, M. et al. Lipoxygenase inhibition by flavonoids: semiempirical study of the structure–activity relation. Journal of Molecular Structure: THEOCHEM, v. 674, n. 1-3, p. 121-124, 2004.

RUIJTERS, E. J. B. et al. The anti-inflammatory efficacy of dexamethasone is protected by (−)-epicatechin. PharmaNutrition, v. 2, n. 2, p. 47-52, 2014.

TROTT, O.; OLSON, A. J. AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization, and multithreading. Journal of computational chemistry, v. 31, n. 2, p. 455-461, 2010.

VERLI, H. Bioinformática: da biologia à flexibilidade molecular. 2014.

XING, J. et al. Epicatechin alleviates inflammation in lipopolysaccharide-induced acute lung injury in mice by inhibiting the p38 MAPK signaling pathway. International immunopharmacology, v. 66, p. 146-153, 2019.