Determinação da estrutura cristalina do N-(piridin-4-il)-benzamida.

ISBN 978-85-85905-15-6

Área

Química Inorgânica

Autores

Santos, S. (IQSC/USP) ; Wegermann, C. (IQ/USP) ; Ferreira, A.M. (IQ/USP) ; Santos, R. (IQSC/USP)

Resumo

As doenças parasitárias afetam milhões de pessoas em todas as parte do planeta, sendo em sua maioria negligenciadas pelas autoridades. A leishmaniose é uma doença de caráter zoonótico que ataca o homem e diversos animais silvestres e domésticos Neste trabalho foi caracterizado estruturalmente por difração de raios X (DRX), à temperatura de 293K, o ligante N-(piridin-4-il)-benzamida, usando um monocristal com as dimensões 0,04 x 0,03 x 0,01 mm. Para a coleta das intensidades utilizou-se a radiação MoKα (λ= 0,71073Ǻ). O modelo final mostrou um índice de discordância de R1 = 0,0370, Rw = 0,0967 e S = 1,10, Os resultados das distâncias e dos ângulos interatômicos, estão de acordo com os valores normais e esperados.

Palavras chaves

Doenças Parasitárias; Leishmaniose; Raios X

Introdução

As doenças parasitárias afetam milhões de pessoas e os maiores casos ocorrem em locais de pessoas com baixo poder aquisitivo e sem qualquer influência política, logo não existem ou são muito escassos os investimentos para a pesquisa de novos fármacos, mais eficientes para o tratamento de tais doenças (SABINO et al, 2013). Nos últimos anos, o Brasil tem apresentado dados significativos na redução de doenças transmissíveis, já que dispõe de instrumentos eficazes de prevenção e controle, estando estas em declínio. Algumas doenças transmissíveis que apresentam quadro de persistência, ou de redução, pode-se citar a leishmaniose (visceral e tegumentar), que tem sido associada às modificações ambientais provocadas pelo homem, ao deslocamento populacional, assim como à falta de infraestrutura na rede de água e esgoto (BRASIL, 2004). A Leishimania, possui em média 30 espécies que infectam diferentes mamíferos e são transmitidas por diversos invertebrados da família dos Psychodidae. Estão presentes em regiões de clima tropical e subtropical em todo mundo, exceto na Oceania (LAURENTI et al, 2010; DESJEUX, 2004). As espécies, da Leishmania, que dão origem aos principais sinais clínicos, possuem duas formas que são subdivididas em: leishmaniose tegumentar (LT) e leishmaniose visceral (LV), sendo está última uma das formas mais graves, comuns em cães e gatos (ACOSTA, 2013; MICHALSKY et al,2002). Este trabalho tem como objetivo apresentar a estrutura do ligante N- (piridin-4-il)-benzamida que será usado como uma ponte para obtenção de complexos que serão testados contra leishmaniose.

Material e métodos

Os monocristais utilizados nesta etapa, foram obtidos do Laboratório de Bioinorgânica, Catálise e Farmacologia do Instituto de Química da Universidade de São Paulo (Campus São Paulo). Os monocristais estavam apropriados para a coleta de dados e não foi preciso passar pelo processo de recristalização. Com ajuda de um microscópio de luz polarizada, foi escolhido um monocristal de dimensões adequadas, que foi colocados em fibra de vidro, e fixado na cabeça goniométrica do difratômetro. A coleta de dados das intensidades dos feixes difratados, foi feita no difratômetro BRUKER APEX II Duo, equipado com sistema OXFORD de baixa temperatura, instalado no laboratório de Difração de Raios X de Monocristal da Central de Análises Químicas e Instrumentais (CAQI) do Instituto de Química de São Carlos da Universidade de São Paulo. A resolução da estrutura foi realizada pelos métodos diretos utilizando o sistema WingX (FARRUGIA, 2012), e o modelo foi refinado (usando SHELX97 (SHELDRICK, 2012)) por mínimos quadrados usando matriz completa em F2.

Resultado e discussão

Os parâmetros cristalinos da cela unitária, assim como os demais dados obtidos na resolução da estrutura são apresentados na Tabela 1. As distâncias e ângulos de ligação para os átomos, exceto os de hidrogênio, são encontrados nas Tabelas 2 e 3, respectivamente. A representação da molécula com os átomos identificados está apresentada na Figura 1. Os parâmetros cristalográficos obtidos foram: sistema cristalino monoclínico, grupo espacial P21/c. Os parâmetros cristalográficos são: a = 5,707 (5), b = 11,218(5), c = 15,250(5) Å, ß = 95,279(5)°, Z = 4 moléculas/célula unitária, V= 972,2(10) Å3 e F(000) = 416. Foram coletadas 1777 reflexões, sendo 1611 consideradas observadas [I > 2.0 σ(I)]. O final do refinamento foi considerado quando o deslocamento ̸ erro tornou-se ≤ 0,01, e com as densidades eletrônicas residuais, mínima e máxima, de -0.23 e 0.21 e ̸ Å3 respectivamente, confirmando que todos os átomos foram identificados. O modelo final mostrou um índice de discordância de R1 =0,0370, Rw = 0,0967 e S = 1,10, Os resultados das distâncias e dos ângulos interatômicos, obtidos pelo sistema PLATON (SPEK, 2011) estão de acordo com os valores normais e esperados. Os ângulos e distâncias interatômicas não apresentam nenhuma divergência em relação aos valores padrões encontrados na literatura para tais ligações (LIU et al, 2002; YAMASHITA et al, 2014) .

Tabela 1 - Resumo dos principais dados cristalográficos para o N-(piridin-4-il)-benzamida Figura 1 - Representação do N-(piridin-4-il)- benzamida


Tabela 2 – Distâncias interatômicas (Å) para o N-(piridin-4-il)-benzamida. Tabela 3 – Ângulos interatômicos (°) para o N- (piridin-4-il)-benzamida.

Conclusões

De acordo com os dados obtidos, os ângulos e distâncias interatômicas não apresentam nenhuma divergência em relação aos valores padrões encontrados na literatura para tais ligações e o desenho da estrutura está de acordo com o esperado.

Agradecimentos

FAPEMA E CNPq

Referências

ACOSTA, I.C.L. Diversidade de parasitas dos gêneros Leishmania e Trypanosoma em animais silvestres de uma unidade de conservação e animais domésticos do seu entorno no Estado do Espírito Santo. Dissertação. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo, 2013

Brasil. Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Departamento de Vigilância Epidemiológica. Doenças infecciosas e parasitárias: guia de bolso. Ministério da Saúde, Secretaria de Vigilância em Saúde, Departamento de Vigilância Epidemiológica. – 4. ed. ampl.– Brasília: Ministério da Saúde, 2004.

DESJEUX, P. Leishmaniasis: current situation and new perspectives. Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Disease, v. 27, n. 5, p. 305-318, 2004.

FARRUGIA, L,J, WinGX-Version 2013,3, J, Appl, Cryst, 45, 849-854, 2012.

LAURENTI, M, D,.Patologia e Patogênia das Leishmanioses. Tese, Universidade de São Paulo, 2010.

LIU, Z., FANG, Q., YU, W., XUE, G., CAO, D., JIANG, M. 2’-Hydroxy-4’’-dimethylamino-Chalcone. Acta Cryst. (2002). C58, 445-446.

MICHALSKY, E.M., FORTES-DIAS, C.L., PIMENTA, P.F., SECUNDINO N.F., DIAS, E.S. Assessment of PCR in the detection of Leishmania spp in experimentally infected individual phlebotomine sandflies (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae). Rev Inst Med Trop Sao Paulo 44: 255-259, 2002.

SABINO, G.L., COUTO, R.A, RIBEIRO, G.A., VIEIRA, L.Q., FERREIRA, A.M.C. Investigação da reatividade de complexos metálicos com ligantes base de Schiff frente a infecções parasitárias. 36a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2013.

SHELDRICK, G,M,, SHELX97 Program for the Solution and Refinement of Crystal Structures, University of Göttingen, Germany, 2012

SPEK, A,L, (2009) Acta Cryst, D65, 148-155, PLATON – A Multipurpose Crystallographic Tool Utrecht University, Utrecht, The Netherlands, A,L,Spek (2011).

YAMASHITA, H., ABE, J. Remarkable Solvatochromic Color Change via Proton Tautomerism of a Phenol-Linked Imidazole Derivative. J. Phys. Chem. A 2014, 118, 1430−1438.