ISBN 978-85-85905-10-1
Área
Físico-Química
Autores
Oliveira, D.A. (UFT) ; Freitas, L.G. (UFT)
Resumo
Neste trabalho foram realizados cálculos de estrutura eletrônica a fim de verificar de qual modo se realiza a interação da molécula 4-amino-1,6-dihidro-2- metoxi-6-oxipirimidína com um nanotubo simples de carbono. Para a execução deste fim foram selecionados alguns funcionais (PW91, B3LYP, D97D) de densidade e o método semi-empírico PM6 para adequação do método ao propósito do trabalho, que é a descrição da interação pi-stacking entre a poliamina do ligante e o nanotubo. Foi verificado que o método semi-empírico PM6 consegue predizer a interação pi- stacking de modo similar a métodos com correlação como MP2 e funcionais com dispersão (B97D), apresentando similaridade com a interação predita na literatura entre essa mesma molécula e uma superfície de carbono ativado.
Palavras chaves
Nanotubo; Teoria do Funcional ; Poliamina
Introdução
Os nanotubos de carbono de parede simples são construídos por uma lamina de grafeno curvadas e fechadas. As propriedades dos nanotubos podem ser modificas via a interação intermolecular ou ligação covalente com moléculas específicas, resultando em mudanças estruturais e eletrônicas, constituindo deste modo a conhecida funcionalização do nanotubo. Em um dos grupos de pesquisa do Departamento de Química Inorgânica e Orgânica da Universidade de Jaén (Espanha), foram realizados procedimentos de funcionalização dos nanotubos, baseando-se na adsorção de receptores aromáticos portadores de funções capazes de complexar metais de forma seletiva, objetivando obter materiais como adsorventes de íons e também para seu uso como catalisadores híbridos (GUTÉRREZ-VALERO, M.D, 2007) (GARCÍA-MARTÍN, l, 2005). A associação do nanotubo com receptores específicos mediante adsorção permite estender à aplicação desta molécula a construção de dispositivos com propriedades catalíticas, redox e fotovoltaicas (BERTELMESS, J, 2001). Nesse trabalho será apresentado um modo de interação entre a molécula 4-amino- 1,6-dihidro-2-metoxi-6-oxipirimidina e um nanotubo de parede simples a fim de verificar a disposição geométrica/espacial deste complexo, objetivando a funcionalização do mesmo para aplicações ambientais e catalíticas. Para a realização deste fim serão realizados cálculos teóricos utilizando a teoria funcional de densidade (DFT) (HOHENBERG, P. et al, 1964) (R. G. Parr et al, 1989) o funcional B3LYP, o funcional PW91, o funcional B97D e o método semi- empírico PM6 presente no programa Gaussian 2009 (M. J. F. et al) pare descrever a interação stacking entre o nanotubo e a molécula 4-. amino-1,6-dihidro-2- metoxi-6-oxipirimidina.
Material e métodos
A molécula de 4-amino-1,6-dihidro-2-metoxi-6-oxipirimidina foi desenhada utilizando o programa HYPERCHEM (HyperChem). O nanotubo de carbono de parede simples, com diâmetro de 13A e comprimento de 25 A, foi construído utilizando o programa AVOGRADO (M. J. F. et al, 2009) e a função “nanotube builder”. A molécula de 4-amino-1,6-dihidro-2-metoxi-6-oxipirimidina foi otimizada previamente no vácuo utilizando o funcional PW91, B3LYP, B97D e a função de base 3-21g, e o método PM6. Após esta etapa a molécula 4-amino-1,6-dihidro-2-metoxi- 6-oxipirimidina foi adsorvida sobre o nanotubo a uma distância de 4.4 angstrons em relação ao nitrogênio do anel de pirimidina e 9.0 angstrons em relação a poliamina. Para cada aproximação teórica foram gerados complexos ligante/nanotubos, os quais foram otimizados buscando uma estrutura de equilíbrio.
Resultado e discussão
O resultados dos cálculos de otimização de geometria do complexo
nanotube/ligante são mostrados abaixo na Figura 1. No intuito de verificar
qual modelo é mais realístico, foram comparados as distâncias pi-stacking dos
mesmos com aquelas conhecidas na literatura conforme a Tabela 1. O sistema
molecular estudado pode em parte ser comparado com o sistema estudado por
Chinagandham e colaboradores (RAJESH, C., 2009). Neste trabalho foi utilizado a
aproximação MP2 (Moller Plesset Pertubation Theory) (M. Head-Gordon et al, 1988)
a fim de proporcionar uma predição mais acurada da interação pi stacking em
aminoácidos. Tendo em vista este modelo de interação que se assemelha em parte
ao estudado neste trabalho, pode se verificar que o funcional de densidade B97D
e o método semi-empírico PM6, são aqueles que mais se aproximam do modelo da
literatura. Considerando-se a relação esforço computacional e acurácia do
método, pode se destacar a utilização do método semi-empírico PM6, que propicia
a predição da interação pi-stacking no sistema de modo similar ao funcional
B97D. Os cálculos provenientes destes métodos preveem uma interação off-set para
interação pi-stacking entre a poliamina e o nanotubo de parede simples. A
disposição da poliamina predita pelos cálculos de estrutura eletrônica se
coaduna com aquela observada na literatura para a interação com carvão ativado
(ARRANZ P. et al, 2010).
Conclusões
Os cálculos de estrutura eletrônica mostram que a interação pi-stacking entre a molécula 4-amino-1,6-dihidro-2-metoxi-6-oxipirimidina e o nanotubo de parede simples se dá sobre o modelo off-set. No que reporta a adequação dos métodos a modelos teóricos com correlação pós-Hartree-Fock em sistemas moleculares semelhantes, destaca-se o método-semi-empírico PM6 e o funcional B97D.
Agradecimentos
Referências
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